Depuis la saison 1988-1989

2023-2024 (Ligue 2)
7e tour : ES Fosséenne (National 3) - FC Annecy 1-2
8e tour : US Thionville Lusitanos (N3) - FC Annecy

2022-2023 (Ligue 2)
7e tour : FC Annecy (L2) – DN de Combani (R1 Mayotte) 8-1
8e tour : Lyon-La Duchère (National 2) – FC Annecy 2-3
32es de finale : ES Villerupt Thil (Régional 1) - FC Annecy 1-6
16es de finale : ASM Belfort FC (National 2) - FC Annecy 1-1, 3 tab 4
8es de finale : Paris FC (Ligue 2) - FC Annecy 1-1, 5 tab 6
Quarts de finale : Olympique de Marseille (L1) - FC Annecy 2-2, 6 tab 7
Demi-finales : FC Annecy - Toulouse FC (Ligue 1) 1-2

2021-2022 (National) 
5e tour : GFA Rumilly Vallières (National 2) - FC Annecy 3-2

2020-2021 (National)
5e tour : US Arbent-Marchon (R3) - FC Annecy 0-2
6e tour : FC Bourgoin-Jallieu (National 3) - FC Annecy 1-4
7e tour : AC Seyssinet (R1) - FC Annecy 0-4
8e tour : Vénissieux FC (R1) - FC Annecy 0-1
32es de finale : FC Fleury 91 (National 2) - FC Annecy 1-1, 4 t.a.b 5
16es de finale : GFA Rumilly-Vallières (National 2) - FC Annecy 1-1, 6 t.a.b. 5

1992-1993 (Division 2)
8e tour : US Annecy-le-Vieux - FC Annecy 0-2
32es de finale : ES Vitrolles (DH) - FC Annecy 2-4
16es de finale : FC Annecy - Paris Saint-Germain FC (Division 1) 0-1

1991-1992 (Division 2)
7e tour : SEC Bastia (Division 2) - FC Annecy 3-0

1990-1991 (Division 2)
8e tour : Maccabi Lyon-Villeurbanne (Prom. distr.) -  FC Annecy 1-7
32es de finale : Association Troyes AC (Division 3) - FC Annecy 1-2 a.p.
16es de finale : FC Annecy - AS Nancy Lorraine (Division 1) 1-0 a.p.
8es de finale : FC Annecy - Stade Ruthénois (Division 2) 0-2

1989-1990 (Division 2)
8e tour : CS Cuiseaux-Louhans (Division 2) - FC Annecy 1-0

1988-1989 (Division 2)
7e tour : FC Annecy - informations à venir